診断機でダイアグを確認、異常出力はありません。
データモニターや目視でのサーボモーターの動きも確認しますが異常ありません。
ここまでで故障箇所が2ヶ所に絞られました。
あとは実際にエアコンユニットを下ろさないと確認できません。
ユニットを下ろし、ヒーターコアを取り外しました。
内部の冷却水を抜き、ビニール袋に入れてそっとしておくと、画像のような異物が沈殿しました。

ヒーターコアの入口と出口がある方が運転席側の吹出し口、奥が助手席側の吹出し口、
つまり異物が奥へ奥へ流れて、助手席側のヒーターコアに温水が流れなくなっていたのです。

これで原因が分かりました。
ちなみに、故障原因は2ヶ所考えられましたが、もう1ヶ所は正常でした。

ヒーターユニットを新品に交換して、完成です。